1.行政管理系統

在醫院信息系統中，醫院行政管理子系統涉及醫院的各科室的行政管理，主要包括人事管理系統、財務管理系統、后勤管理系統、藥庫管理系統、醫療設備管理系統、門診和手術及住院預約系統、病人住院管理系統等。

2.醫療管理系統

醫療管理系統主要是醫院涉及的醫療業務方面的信息處理，主要包括門診、急診管理系統，病案管理系統，醫療統計查詢系統，血庫管理系統等。

3.決策支持系統

決策支持系統主要是有關醫療業務質量等方面的處理，包括醫療質量評價系統、醫療質量控制系統等。

4.其他各種輔助系統

除了以上的行政管理系統、醫療相關業務處理系統，還有其他的輔助系統，如醫療情報檢索系統、醫療數據庫系統等。

1、技術支持：計算機、計算機網絡（與通信）技術是醫院信息系統的硬件支撐；網絡管理系統、數據庫技術與數據庫系統是醫院信息系統的軟件環境。

2、支持聯機事務處理：醫院中的信息流是伴隨著各式各樣窗口業務處理過程發生的，這些窗口業務處理可能是醫院人、財、物的行政管理業務，也可能是有關門、急診病人、住院病人的醫療事務；而HIS的分系統、子系統的劃分和設計要支持這些日常的、大量的前臺事務處理。

3、支持管理部門的信息匯總與分析：醫院的科室擔負著繁重的管理任務，隨著科室管理工作的日趨科學化，會越來越多地依賴于它們從基層收集來的基本數據進行匯總、統計與分析，用來評價他們所管理的基層部門與個人的工作情況，據此做出計劃，督促執行，產生報告和做出決定。計算機化的信息系統要支持中層科室的數據收集、綜合、匯總、分析報告與存儲的工作。

4、醫療信息的復雜性與標準化：病人的信息是以多種數據類型表達的，不僅有文字與數據，還需要圖形、圖表、影像等；它處理的數據對象既有結構化數據，也有半結構化或非結構化數據；甚至有些數據及結構會較多地受到人工干預和社會因素的影響。解決醫療信息復雜問題的關鍵是實現醫療信息標準化。

5、信息的安全性與保密性：病人醫療記錄是一種擁有法律效力的文件，它不僅在醫療糾紛案件中，而且在許多其他的法律程序中均會發揮重要作用，同時還經常涉及病人的隱私。有關人事的、財務的，乃至病人的醫療信息均有嚴格的保密性要求。

6、醫院信息系統的生命性：醫院信息系統是醫院現實的業務經營和管理以及改革方案在信息系統中的映射，當醫院的醫院信息系統建成后，它對醫院的經營、管理及其改革就起著促進的作用；但與此同時，信息系統的不足和缺陷就會在新的實際環境及各部門新的協同需求中突現出來；信息系統又面臨新的矛盾，需要作新的改進。醫院信息系統對醫院實際系統的這種依存關系，正是醫院信息系統生命性的具體體現。只有當醫院業務發展到了相對飽和和穩定的階段，醫院信息系統的穩定期才會出現。

1、醫生就診：主要是對就診病人進行檢查信息的錄入、開電子處方、患者病歷書寫、門診手術治療申請單、各種醫技檢查申請單編輯等。

2、查詢功能：查詢就診病人的檢查報告、門診手術等情況，并提供藥品、門診就診、門診處方收費情況、門診病歷查詢、復診預約、住院預約等功能。

3、住院：對門診病人進行住院預約以及查詢住院部的床位使用情況。

4、數據設置：提供醫生科室權力設置、藥品套餐維護、項目套餐維護、病歷模板維護、病歷向導維護、發藥藥房維護、醫技申請單、醫技接口等功能。

5、系統：提供用戶及其權限的設置、密碼修改、計算器、系統初始化等功能。

1、規范化、標準化，專業穩定

高度符合行業專業規范，大量采用國際、國內及行業信息標準，遵守醫療管理及醫療技術操作規范。

2、實用性、通用性強

支持管理模式的參數化配置，廣泛適應醫療機構現在和未來多種成功管理模式。

3、系統安裝、建立、使用、維護簡單方便

充分考慮到中小醫院和社區中心電腦人員的不足，軟件包提供了自助工具，使得軟件在最短時間內安裝建立并投入正式運轉。

4、可以一站式辦公管理

滿足醫院、診所和社區基本的辦公需求功能。有效提升內部辦公效率和信息及知識交流，提升醫院競爭力，提高醫院辦公效率，也提升了醫院信息交互的便捷性。

1、加強醫院安全管理體系建設，不斷完善相關的規章制度。

2、加強對醫院信息系統使用人員的業務培訓和保密安全培訓工。

3、建立系統安全監控體系以及應急預案。

4、加大醫院信息系統設備以及軟件更新的投入，加快更新頻率。